Ученые Института персонализированной онкологии Сеченовского Университета внедрили в клиническую практику платформу «Онкобокс», которая анализирует опухоли с помощью секвенирования РНК в их образцах и составляет рейтинг эффективности таргетных препаратов для конкретного пациента. Результаты исследования описаны в статье, опубликованной в журнале Computers in Biology and Medicine.
Изучение экспрессии (активности) генов опухоли с помощью РНК-секвенирования показывает, молекулярные мишени каких противораковых препаратов в данной опухоли активны, а каких — подавлены. Новый подход для подбора персонализированной терапии рака заключается в анализе профилей секвенирования РНК в материале опухоли. Алгоритм платформы «Онкобокс» выявляет измененную активность генов-мишеней лекарственных препаратов и молекулярных путей и из множества существующих препаратов подбирает самые эффективные для конкретного пациента.
Используемый сегодня подбор лечения на основе диагностических мутаций ДНК полезен лишь для 15-20% онкопациентов, т.к. у остальных в опухоли таких мутаций просто не оказывается, тогда как подбор на основе анализа РНК будет эффективен практически для всех. Внедрение этой технологии поможет увеличить продолжительность жизни десятков тысяч больных с опухолями поздних стадий.
Ученые провели первое проспективное клиническое исследование, где терапию онкобольным назначали с использованием алгоритма, анализирующего профили РНК. В нем приняли участие 239 взрослых с солидными злокачественными, преимущественно метастатическими опухолями. 135 из них получали лекарственную терапию, остальные — лучевую терапию или паллиативное лечение. Препараты, рекомендованные аналитической платформой «Онкобокс», были назначены 59% участников исследования. Остальным пациентам (контрольная группа) назначали лечение по стандартным протоколам.
Отмечается, что участники, которым назначили терапию с учетом составленных алгоритмом индивидуальных рейтингов, прошли намного больше предварительных линий лекарственных терапии по сравнению с контрольной группой, что говорит о большей тяжести заболевания. Но именно у них зафиксировали более длительную беспрогрессивную выживаемость. Результаты клинического исследования подтвердили, что подбор противораковой терапии на основе анализа РНК опухоли позволяет почти вдвое повысить вероятность ответа на терапию пациентов на поздних стадиях, а также увеличить безрецидивный период в среднем на 10 месяцев.
