Ученые из компании Tally Health (США), создавшие «часы» второго поколения CheekAge, которые основаны на данных о метилировании в легко собираемых клетках изнутри щек, доказали, что они могут предсказывать риск смертности. Результаты исследования описаны в статье, опубликованной в журнале Frontiers in Aging.
За последние годы ученые разработали несколько «эпигенетических часов», откалиброванных по хронологическому возрасту и разным факторам образа жизни на большом количестве людей. В основном они сфокусированы на метилировании ДНК в клетках крови, что делает сбор образцов обременительным и стрессовым для пациента.
В начале 2024 года были разработаны «часы» второго поколения под названием CheekAge, которые основаны на данных о метилировании в легко собираемых клетках изнутри щек. Сейчас авторы этой разработки показали, что CheekAge может точно предсказывать риск смертности, даже если в качестве исходных данных используются эпигенетические данные из другой ткани.
Исследователи также установили, что конкретные участки метилирования особенно важны для этой корреляции, выявив потенциальные связи между конкретными генами и процессами и смертностью, улавливаемые часами. В своей работе ученые использовали статистическое программирование, чтобы проверить, насколько хорошо оно предсказывает смертность от любой причины у 1513 женщин и мужчин, родившихся в 1921 и 1936 гг и всю жизнь наблюдавшихся в рамках программы Lothian Birth Cohorts (LBC) Эдинбургского университета.
Одна из целей LBC — связать различия в когнитивном старении с образом жизни и психосоциальными факторами, а также биомедицинскими, генетическими, эпигенетическими данными и визуализацией мозга. Каждые 3 года у добровольцев измерялся метилом в клетках крови на примерно 450 000 участков метилирования ДНК. Последняя доступная временная точка метилирования использовалась вместе со статусом смертности для расчета CheekAge и его связи с риском смертности.
CheekAge значительно превосходит часы первого поколения, обученные на данных анализа крови. Так, при увеличении показателя на одно стандартное отклонение коэффициент риска смертности от всех причин увеличивался на 21%. Это означает, что CheekAge связан с риском смертности у пожилых людей. Авторы исследования убеждены: то, что эпигенетические часы, натренированные на клетках щек, предсказывают смертность при измерении метилома в клетках крови, говорит о существовании общих сигналов смертности в разных тканях. Это может помочь в изучении механизмов старения.