02.10.2024

По клеткам полости рта возможно оценить риск смерти человека

По клеткам полости рта возможно оценить риск смерти человека

Ученые из компании Tally Health (США), создавшие «часы» второго поколения CheekAge, которые основаны на данных о метилировании в легко собираемых клетках изнутри щек, доказали, что они могут предсказывать риск смертности. Результаты исследования описаны в статье, опубликованной в журнале Frontiers in Aging.

За последние годы ученые разработали несколько «эпигенетических часов», откалиброванных по хронологическому возрасту и разным факторам образа жизни на большом количестве людей. В основном они сфокусированы на метилировании ДНК в клетках крови, что делает сбор образцов обременительным и стрессовым для пациента.

В начале 2024 года были разработаны «часы» второго поколения под названием CheekAge, которые основаны на данных о метилировании в легко собираемых клетках изнутри щек. Сейчас авторы этой разработки показали, что CheekAge может точно предсказывать риск смертности, даже если в качестве исходных данных используются эпигенетические данные из другой ткани.

Исследователи также установили, что конкретные участки метилирования особенно важны для этой корреляции, выявив потенциальные связи между конкретными генами и процессами и смертностью, улавливаемые часами. В своей работе ученые использовали статистическое программирование, чтобы проверить, насколько хорошо оно предсказывает смертность от любой причины у 1513 женщин и мужчин, родившихся в 1921 и 1936 гг и всю жизнь наблюдавшихся в рамках программы Lothian Birth Cohorts (LBC) Эдинбургского университета.

Одна из целей LBC — связать различия в когнитивном старении с образом жизни и психосоциальными факторами, а также биомедицинскими, генетическими, эпигенетическими данными и визуализацией мозга. Каждые 3 года у добровольцев измерялся метилом в клетках крови на примерно 450 000 участков метилирования ДНК. Последняя доступная временная точка метилирования использовалась вместе со статусом смертности для расчета CheekAge и его связи с риском смертности.

CheekAge значительно превосходит часы первого поколения, обученные на данных анализа крови. Так, при увеличении показателя на одно стандартное отклонение коэффициент риска смертности от всех причин увеличивался на 21%. Это означает, что CheekAge связан с риском смертности у пожилых людей. Авторы исследования убеждены: то, что эпигенетические часы, натренированные на клетках щек, предсказывают смертность при измерении метилома в клетках крови, говорит о существовании общих сигналов смертности в разных тканях. Это может помочь в изучении механизмов старения.



СМОТРИТЕ ТАКЖЕ